Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK3Q15120 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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