Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PDK1Q15118 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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