Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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