Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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