Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PEX6Q13608 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PEX6Q13608 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PEX6Q13608 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PEX6Q13608 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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