Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
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