Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
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