Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BFSP2Q13515 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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