Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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ITGB3BPQ13352 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3BPQ13352 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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ITGB3BPQ13352 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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ITGB3BPQ13352 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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ITGB3BPQ13352 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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ITGB3BPQ13352 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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ITGB3BPQ13352 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3BPQ13352 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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