Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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