Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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