Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRAF3Q13114 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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TRAF3Q13114 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TRAF3Q13114 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAF3Q13114 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAF3Q13114 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAF3Q13114 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TRAF3Q13114 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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TRAF3Q13114 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF3Q13114 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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