Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms