Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms