Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YKL136WYKL136W 399 nt1.35□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YKL118WYKL118W 312 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 AIM44YPL158C 2277 nt1.34□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 IML1YJR138W 4755 nt1.34□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 OST1YJL002C 1431 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 SWI4YER111C 3282 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YFL032WYFL032W 321 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 RPL34BYIL052C 366 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YIR044CYIR044C 186 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 LAA1YJL207C 6045 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 PKH2YOL100W 3246 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 CUL3YGR003W 2235 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 ALY2YJL084C 3141 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 CDC25YLR310C 4770 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YDR413CYDR413C 576 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YLL020CYLL020C 306 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 FIG4YNL325C 2640 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 SLD3YGL113W 2007 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 ROM2YLR371W 4071 nt1.31□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 NUP145YGL092W 3954 nt1.31□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 NST1YNL091W 3723 nt1.31□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YCK3YER123W 1575 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 MMS4YBR098W 2076 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 IFH1YLR223C 3258 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YER097WYER097W 330 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 APL3YBL037W 3078 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 SET3YKR029C 2256 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 CLU1YMR012W 3834 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 DBP6YNR038W 1890 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 GPG1YGL121C 381 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YPR063CYPR063C 423 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YDL206WYDL206W 2289 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 YLL007CYLL007C 1998 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 HTL1YCR020W-B 237 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 SSS1YDR086C 243 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC39Q12745 STO1YMR125W 2586 nt1.27□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 RAD9YDR217C 3930 nt1.26□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 PTP2YOR208W 2253 nt1.26□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 VAM6YDL077C 3150 nt1.26□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YFL063WYFL063W 456 nt1.26□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 RPL33BYOR234C 324 nt1.26□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YDR521WYDR521W 336 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YGL149WYGL149W 306 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 PDE2YOR360C 1581 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YIL032CYIL032C 357 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 EAF1YDR359C 2949 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 SPO75YLL005C 2607 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 CDC39YCR093W 6327 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YAR009CYAR009C 3591 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 HMRA2YCR096C 360 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YDR344CYDR344C 444 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 RPL39YJL189W 156 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 YBR206WYBR206W 324 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 STB6YKL072W 2301 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 STE5YDR103W 2754 nt1.22□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 snR60snR60 104 nt1.22□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 BUD3YCL014W 4911 nt1.22□□□□□ -2.21
SEC39Q12745 PAN2YGL094C 3348 nt1.21□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 RPS25BYLR333C 327 nt1.21□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.21□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 TTI1YKL033W 3117 nt1.21□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 YJL120WYJL120W 324 nt1.2□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 SEC3YER008C 4011 nt1.2□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 SPO21YOL091W 1830 nt1.19□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 APL1YJR005W 2103 nt1.19□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 INA22YIR024C 651 nt1.19□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 SCC2YDR180W 4482 nt1.19□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 WAR1YML076C 2835 nt1.18□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 DOP1YDR141C 5097 nt1.18□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 VIK1YPL253C 1944 nt1.17□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 ALG13YGL047W 609 nt1.16□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 YHL042WYHL042W 453 nt1.16□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.16□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.16□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 YBR064WYBR064W 429 nt1.16□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 SIP4YJL089W 2490 nt1.16□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 COG8YML071C 1824 nt1.15□□□□□ -2.22
SEC39Q12745 GEA2YEL022W 4380 nt1.15□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 ECM12YHR021W-A 456 nt1.15□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 YMR321CYMR321C 318 nt1.15□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 YNL146WYNL146W 303 nt1.15□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 NUP157YER105C 4176 nt1.14□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 PAU12YGR294W 363 nt1.14□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 PAU24YBR301W 363 nt1.14□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 RPS27BYHR021C 249 nt1.13□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 RPS30BYOR182C 192 nt1.13□□□□□ -2.23
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