Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

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Length 1,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.26□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 CWC23YGL128C 852 nt-0.27□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.27□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YNL150WYNL150W 408 nt-0.27□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 BUD26YDR241W 288 nt-0.28□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YDR269CYDR269C 324 nt-0.28□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 IRC16YPR038W 360 nt-0.29□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.29□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 OLI1Q0130 231 nt-0.29□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YNL211CYNL211C 261 nt-0.29□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 MRPL32YCR003W 552 nt-0.3□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YDR220CYDR220C 294 nt-0.3□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.3□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YKL136WYKL136W 399 nt-0.3□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YBR206WYBR206W 324 nt-0.3□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 COY1YKL179C 2040 nt-0.3□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 VAM3YOR106W 852 nt-0.31□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 CUL3YGR003W 2235 nt-0.31□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 MYO1YHR023W 5787 nt-0.31□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YGL015CYGL015C 393 nt-0.33□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 MAM33YIL070C 801 nt-0.33□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 CMC1YKL137W 336 nt-0.33□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YLR198CYLR198C 360 nt-0.33□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YLR217WYLR217W 324 nt-0.33□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.33□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YOR345CYOR345C 351 nt-0.33□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 NIP1YMR309C 2439 nt-0.34□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YAP6YDR259C 1152 nt-0.34□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YNL146WYNL146W 303 nt-0.34□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YPL261CYPL261C 309 nt-0.35□□□□□ -2.46
YPK9Q12697 YER135CYER135C 393 nt-0.35□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YGL239CYGL239C 315 nt-0.35□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 EFR3YMR212C 2349 nt-0.36□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YKU70YMR284W 1809 nt-0.36□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.36□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YDL187CYDL187C 330 nt-0.37□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YGR228WYGR228W 345 nt-0.37□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 NFU1YKL040C 771 nt-0.37□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 AFB1YLR040C 675 nt-0.37□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 snR8snR8 190 nt-0.38□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YDR210WYDR210W 228 nt-0.38□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 PBI2YNL015W 228 nt-0.38□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.38□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 SNU56YDR240C 1479 nt-0.39□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 PAA1YDR071C 576 nt-0.39□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 ECM9YKR004C 1134 nt-0.39□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YBL062WYBL062W 381 nt-0.39□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YNR077CYNR077C 255 nt-0.39□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 DCP1YOL149W 696 nt-0.39□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 snR5snR5 204 nt-0.4□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YPR039WYPR039W 336 nt-0.4□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 HUR1YGL168W 333 nt-0.41□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 RPS20YHL015W 366 nt-0.41□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.41□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YJR011CYJR011C 786 nt-0.41□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.41□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 POP7YBR167C 423 nt-0.41□□□□□ -2.47
YPK9Q12697 YEL073CYEL073C 324 nt-0.41□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YML108WYML108W 318 nt-0.41□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 IPP1YBR011C 864 nt-0.41□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YIR044CYIR044C 186 nt-0.42□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YKL202WYKL202W 582 nt-0.42□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.42□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YPL225WYPL225W 441 nt-0.42□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 SEC10YLR166C 2616 nt-0.43□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YPT6YLR262C 648 nt-0.43□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.44□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 SCEIQ0160 708 nt-0.44□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-0.44□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 SBH2YER019C-A 267 nt-0.45□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.45□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.45□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.45□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 APQ13YJL075C 417 nt-0.46□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 YLR171WYLR171W 390 nt-0.46□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 UBS1YBR165W 834 nt-0.46□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 snR72snR72 98 nt-0.47□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 snR9snR9 187 nt-0.47□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 RAD61YDR014W 1944 nt-0.47□□□□□ -2.48
YPK9Q12697 ILM1YJR118C 612 nt-0.48□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 SPO21YOL091W 1830 nt-0.48□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 snR128snR128 126 nt-0.48□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 snR51snR51 107 nt-0.48□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 YGL230CYGL230C 444 nt-0.49□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 YGR115CYGR115C 780 nt-0.49□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.49□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 YOL029CYOL029C 606 nt-0.49□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 YPL182CYPL182C 384 nt-0.5□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.51□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.53□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 MND1YGL183C 660 nt-0.53□□□□□ -2.49
YPK9Q12697 YGR025WYGR025W 303 nt-0.54□□□□□ -2.5
YPK9Q12697 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.54□□□□□ -2.5
YPK9Q12697 PTP2YOR208W 2253 nt-0.54□□□□□ -2.5
YPK9Q12697 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.54□□□□□ -2.5
YPK9Q12697 ATG31YDR022C 591 nt-0.55□□□□□ -2.5
YPK9Q12697 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.55□□□□□ -2.5
YPK9Q12697 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.55□□□□□ -2.5
YPK9Q12697 SDH7YDR511W 402 nt-0.56□□□□□ -2.5
YPK9Q12697 YMR254CYMR254C 309 nt-0.56□□□□□ -2.5
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