Protein–RNA interactions for Protein: Q12499

NOP58, Nucleolar protein 58, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP58Q12499 YFL032WYFL032W 321 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP58Q12499 YIR044CYIR044C 186 nt1.41□□□□□ -2.18
NOP58Q12499 MSN5YDR335W 3675 nt1.4□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 SWI4YER111C 3282 nt1.4□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YDR413CYDR413C 576 nt1.4□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 RPL34BYIL052C 366 nt1.4□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 CUL3YGR003W 2235 nt1.39□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YCK3YER123W 1575 nt1.39□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 PKH2YOL100W 3246 nt1.39□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YER097WYER097W 330 nt1.39□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 RPL33BYOR234C 324 nt1.39□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 AIM44YPL158C 2277 nt1.39□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 SLD3YGL113W 2007 nt1.39□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 IFH1YLR223C 3258 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 APL3YBL037W 3078 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 MMS4YBR098W 2076 nt1.38□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 HTL1YCR020W-B 237 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YFL063WYFL063W 456 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YPR063CYPR063C 423 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.37□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 FIG4YNL325C 2640 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 SET3YKR029C 2256 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 GPG1YGL121C 381 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 DBP6YNR038W 1890 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 CDC31YOR257W 486 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YLL007CYLL007C 1998 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 SSS1YDR086C 243 nt1.35□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YDL206WYDL206W 2289 nt1.35□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 CDC39YCR093W 6327 nt1.34□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YDR521WYDR521W 336 nt1.34□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YLL020CYLL020C 306 nt1.34□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.34□□□□□ -2.19
NOP58Q12499 PTP2YOR208W 2253 nt1.34□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 STO1YMR125W 2586 nt1.34□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 SPO75YLL005C 2607 nt1.33□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 VAM6YDL077C 3150 nt1.33□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 HMRA2YCR096C 360 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YGL149WYGL149W 306 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 RPL39YJL189W 156 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 PDE2YOR360C 1581 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 STE5YDR103W 2754 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 NUP145YGL092W 3954 nt1.32□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YDR344CYDR344C 444 nt1.31□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YBR206WYBR206W 324 nt1.31□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 PAN2YGL094C 3348 nt1.31□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YIL032CYIL032C 357 nt1.3□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.3□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 EAF1YDR359C 2949 nt1.3□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YAR009CYAR009C 3591 nt1.29□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 APL1YJR005W 2103 nt1.29□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 STB6YKL072W 2301 nt1.29□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 snR60snR60 104 nt1.28□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 ANS1YHR126C 480 nt1.28□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 INA22YIR024C 651 nt1.28□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YJL120WYJL120W 324 nt1.28□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 RPS25BYLR333C 327 nt1.28□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.28□□□□□ -2.2
NOP58Q12499 NST1YNL091W 3723 nt1.27□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 SPO21YOL091W 1830 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 YNL146WYNL146W 303 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 SEC3YER008C 4011 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 MSH3YCR092C 3057 nt1.26□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 LAA1YJL207C 6045 nt1.25□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 YMR321CYMR321C 318 nt1.24□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 YBR064WYBR064W 429 nt1.24□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 WAR1YML076C 2835 nt1.24□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 VIK1YPL253C 1944 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 YHL042WYHL042W 453 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 COG8YML071C 1824 nt1.22□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 ALG13YGL047W 609 nt1.22□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 SCC2YDR180W 4482 nt1.22□□□□□ -2.21
NOP58Q12499 NUP157YER105C 4176 nt1.21□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.2□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.2□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.2□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.2□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.2□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 RPS27BYHR021C 249 nt1.2□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 DOP1YDR141C 5097 nt1.19□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 CLU1YMR012W 3834 nt1.19□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 SPT7YBR081C 3999 nt1.19□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 YJR029WYJR029W 5268 nt1.19□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.19□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 BEM2YER155C 6504 nt1.19□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 ECM12YHR021W-A 456 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 CSE2YNR010W 450 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 GEA2YEL022W 4380 nt1.17□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 snR65snR65 100 nt1.17□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 YOR218CYOR218C 420 nt1.17□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 ROM2YLR371W 4071 nt1.17□□□□□ -2.22
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