Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YNL146WYNL146W 303 nt-0.49□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 snR128snR128 126 nt-0.49□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YDR220CYDR220C 294 nt-0.5□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YDR269CYDR269C 324 nt-0.5□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 MAM33YIL070C 801 nt-0.5□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YJR011CYJR011C 786 nt-0.5□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 HAL9YOL089C 3093 nt-0.51□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.51□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.51□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.51□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.51□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YPL225WYPL225W 441 nt-0.51□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 RSM23YGL129C 1353 nt-0.52□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.52□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.52□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 HTB1YDR224C 396 nt-0.53□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 CWC23YGL128C 852 nt-0.53□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YNL211CYNL211C 261 nt-0.53□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.53□□□□□ -2.49
RTR2Q12378 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.55□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 NIP100YPL174C 2607 nt-0.55□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 COY1YKL179C 2040 nt-0.55□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 YKU70YMR284W 1809 nt-0.56□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 YEL073CYEL073C 324 nt-0.57□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.57□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.57□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 YOR345CYOR345C 351 nt-0.57□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 NNF2YGR089W 2811 nt-0.57□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 YAP6YDR259C 1152 nt-0.58□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.58□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 ECM9YKR004C 1134 nt-0.58□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 PAA1YDR071C 576 nt-0.59□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 YJL007CYJL007C 315 nt-0.59□□□□□ -2.5
RTR2Q12378 VAM3YOR106W 852 nt-0.6□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 YOR248WYOR248W 303 nt-0.6□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 NIP1YMR309C 2439 nt-0.61□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.61□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 YOL160WYOL160W 342 nt-0.61□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 IRC16YPR038W 360 nt-0.61□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 SNU56YDR240C 1479 nt-0.62□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 YGL015CYGL015C 393 nt-0.64□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 YBR206WYBR206W 324 nt-0.64□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 SPO21YOL091W 1830 nt-0.64□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 YCR022CYCR022C 345 nt-0.65□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 YPR096CYPR096C 303 nt-0.65□□□□□ -2.51
RTR2Q12378 PBI2YNL015W 228 nt-0.66□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 YPL261CYPL261C 309 nt-0.66□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 YIR044CYIR044C 186 nt-0.67□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 HTB2YBL002W 396 nt-0.68□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 YPL205CYPL205C 345 nt-0.68□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 RPM2YML091C 3609 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 BUD26YDR241W 288 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 EMC4YGL231C 573 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 YML108WYML108W 318 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 snR72snR72 98 nt-0.71□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 YGL239CYGL239C 315 nt-0.71□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.72□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 ILM1YJR118C 612 nt-0.72□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 DCP1YOL149W 696 nt-0.72□□□□□ -2.52
RTR2Q12378 YLR171WYLR171W 390 nt-0.74□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 YLR217WYLR217W 324 nt-0.74□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.75□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 UBS1YBR165W 834 nt-0.75□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 PTP2YOR208W 2253 nt-0.75□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.76□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 YGR228WYGR228W 345 nt-0.77□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.77□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.77□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 YKL202WYKL202W 582 nt-0.77□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 YPR039WYPR039W 336 nt-0.77□□□□□ -2.53
RTR2Q12378 MRPL32YCR003W 552 nt-0.79□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 snR5snR5 204 nt-0.79□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 APQ13YJL075C 417 nt-0.79□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 TIM13YGR181W 318 nt-0.81□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 snR33snR33 183 nt-0.81□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 DIE2YGR227W 1578 nt-0.82□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 YER135CYER135C 393 nt-0.82□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 CMC1YKL137W 336 nt-0.82□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.82□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.83□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 snR36snR36 182 nt-0.83□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 YOL029CYOL029C 606 nt-0.84□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 snR161snR161 161 nt-0.84□□□□□ -2.54
RTR2Q12378 ECL1YGR146C 636 nt-0.85□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 RPS20YHL015W 366 nt-0.85□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.85□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 IPP1YBR011C 864 nt-0.85□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 snR51snR51 107 nt-0.85□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.86□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 YNL319WYNL319W 441 nt-0.86□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 YBL062WYBL062W 381 nt-0.89□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.89□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 HUR1YGL168W 333 nt-0.9□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.9□□□□□ -2.55
RTR2Q12378 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.91□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 ATG31YDR022C 591 nt-0.92□□□□□ -2.56
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