Protein–RNA interactions for Protein: Q12289

CRC1, Mitochondrial carnitine carrier, yeastyeast

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CRC1Q12289 AGC1YPR021C 2709 nt1.71□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 UBP15YMR304W 3693 nt1.71□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.7□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 STE11YLR362W 2154 nt1.7□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 NCA2YPR155C 1851 nt1.7□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 snR48snR48 113 nt1.7□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 PET309YLR067C 2898 nt1.7□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 AIM44YPL158C 2277 nt1.7□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 HMI1YOL095C 2121 nt1.7□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 FIG4YNL325C 2640 nt1.7□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 PIP2YOR363C 2991 nt1.69□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 SSD1YDR293C 3753 nt1.69□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 CTR9YOL145C 3234 nt1.69□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 MSB1YOR188W 3414 nt1.69□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 RTT101YJL047C 2529 nt1.68□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 PRP42YDR235W 1635 nt1.68□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 YLR419WYLR419W 4308 nt1.68□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 SCP160YJL080C 3669 nt1.68□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 PTP2YOR208W 2253 nt1.68□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 ALK1YGL021W 2283 nt1.67□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 YDR521WYDR521W 336 nt1.67□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.67□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.67□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 YPR097WYPR097W 3222 nt1.66□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 HAL9YOL089C 3093 nt1.66□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 snR85snR85 171 nt1.66□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 YBR206WYBR206W 324 nt1.66□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 TUS1YLR425W 3924 nt1.66□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 IRE1YHR079C 3348 nt1.66□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 SLD3YGL113W 2007 nt1.66□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.66□□□□□ -2.14
CRC1Q12289 IFH1YLR223C 3258 nt1.65□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 YNL144CYNL144C 2223 nt1.65□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 YDL118WYDL118W 381 nt1.65□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 YFR016CYFR016C 3702 nt1.65□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 UBR2YLR024C 5619 nt1.65□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 BUD2YKL092C 3315 nt1.65□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 MDS3YGL197W 4464 nt1.64□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 SAP190YKR028W 3102 nt1.64□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.64□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 SAP185YJL098W 3177 nt1.63□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 COG4YPR105C 2586 nt1.63□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.63□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 IST2YBR086C 2841 nt1.63□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 PKH2YOL100W 3246 nt1.62□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 PBY1YBR094W 2262 nt1.62□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 FRK1YPL141C 2598 nt1.61□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 IRC8YJL051W 2469 nt1.61□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 GCN2YDR283C 4980 nt1.61□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 SLI15YBR156C 2097 nt1.6□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 RPS30BYOR182C 192 nt1.6□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 YPL044CYPL044C 549 nt1.6□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 SBE22YHR103W 2559 nt1.6□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 RGA1YOR127W 3024 nt1.59□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 TFC3YAL001C 3483 nt1.59□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 SNU13YEL026W 381 nt1.59□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.59□□□□□ -2.15
CRC1Q12289 MSH6YDR097C 3729 nt1.59□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 UTP22YGR090W 3714 nt1.58□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 REV3YPL167C 4515 nt1.58□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 SPP41YDR464W 4308 nt1.58□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.58□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.58□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 IRC20YLR247C 4671 nt1.58□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 SFB2YNL049C 2631 nt1.58□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 BRE1YDL074C 2103 nt1.58□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 FKS1YLR342W 5631 nt1.57□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 PAA1YDR071C 576 nt1.57□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 COX12YLR038C 252 nt1.57□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.57□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 SEY1YOR165W 2331 nt1.57□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 HER1YOR227W 3741 nt1.57□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.56□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 SEC63YOR254C 1992 nt1.56□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 SLN1YIL147C 3663 nt1.56□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 SPO24YPR036W-A 204 nt1.56□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 YOR093CYOR093C 4947 nt1.55□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 MYO4YAL029C 4416 nt1.55□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 YOR102WYOR102W 351 nt1.55□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 UTP21YLR409C 2820 nt1.54□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.54□□□□□ -2.16
CRC1Q12289 ADR1YDR216W 3972 nt1.52□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 UBP2YOR124C 3819 nt1.52□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 MYO2YOR326W 4725 nt1.52□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 CTF4YPR135W 2784 nt1.52□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 NUT1YGL151W 3399 nt1.51□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 TTI1YKL033W 3117 nt1.51□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 PDR8YLR266C 2106 nt1.51□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 RAD50YNL250W 3939 nt1.51□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 APL1YJR005W 2103 nt1.51□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 YDL206WYDL206W 2289 nt1.5□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.5□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.5□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 MON2YNL297C 4911 nt1.5□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 NEO1YIL048W 3456 nt1.5□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 YJR039WYJR039W 3366 nt1.5□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 ATG9YDL149W 2994 nt1.5□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 SIR4YDR227W 4077 nt1.49□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 YJL022WYJL022W 309 nt1.49□□□□□ -2.17
CRC1Q12289 DGR1YNL130C-A 147 nt1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms