Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YJR039WYJR039W 3366 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 SPO21YOL091W 1830 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 RTP1YMR185W 2946 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 IRC20YLR247C 4671 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 MYO4YAL029C 4416 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 RPL34BYIL052C 366 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YJL120WYJL120W 324 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YBR174CYBR174C 315 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YLR419WYLR419W 4308 nt1.82□□□□□ -2.12
HER1Q12276 HIR3YJR140C 4947 nt1.81□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.81□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.81□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.81□□□□□ -2.12
HER1Q12276 DCP2YNL118C 2913 nt1.81□□□□□ -2.12
HER1Q12276 ZIP1YDR285W 2628 nt1.81□□□□□ -2.12
HER1Q12276 GYP5YPL249C 2685 nt1.81□□□□□ -2.12
HER1Q12276 RLM1YPL089C 2031 nt1.8□□□□□ -2.12
HER1Q12276 RPS25BYLR333C 327 nt1.8□□□□□ -2.12
HER1Q12276 PEP1YBL017C 4740 nt1.8□□□□□ -2.12
HER1Q12276 PKH3YDR466W 2697 nt1.8□□□□□ -2.12
HER1Q12276 UTP21YLR409C 2820 nt1.8□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.8□□□□□ -2.12
HER1Q12276 COF1YLL050C 432 nt1.79□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.79□□□□□ -2.12
HER1Q12276 RAD34YDR314C 2079 nt1.79□□□□□ -2.12
HER1Q12276 ZIP2YGL249W 2115 nt1.79□□□□□ -2.12
HER1Q12276 ENV11YGR071C 2583 nt1.78□□□□□ -2.12
HER1Q12276 SEC63YOR254C 1992 nt1.78□□□□□ -2.12
HER1Q12276 YHR210CYHR210C 1026 nt1.78□□□□□ -2.12
HER1Q12276 MAK10YEL053C 2202 nt1.78□□□□□ -2.13
HER1Q12276 SAS3YBL052C 2496 nt1.77□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.77□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.77□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YOR345CYOR345C 351 nt1.77□□□□□ -2.13
HER1Q12276 NOC3YLR002C 1992 nt1.77□□□□□ -2.13
HER1Q12276 CUL3YGR003W 2235 nt1.76□□□□□ -2.13
HER1Q12276 PAU3YCR104W 375 nt1.76□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YNL205CYNL205C 423 nt1.76□□□□□ -2.13
HER1Q12276 RPL33BYOR234C 324 nt1.76□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.76□□□□□ -2.13
HER1Q12276 MAD1YGL086W 2250 nt1.75□□□□□ -2.13
HER1Q12276 APL2YKL135C 2181 nt1.75□□□□□ -2.13
HER1Q12276 PMP1YCR024C-A 123 nt1.74□□□□□ -2.13
HER1Q12276 RPL31AYDL075W 342 nt1.74□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YEL073CYEL073C 324 nt1.74□□□□□ -2.13
HER1Q12276 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.74□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YIR044CYIR044C 186 nt1.74□□□□□ -2.13
HER1Q12276 TDA9YML081W 3756 nt1.74□□□□□ -2.13
HER1Q12276 VPS15YBR097W 4365 nt1.73□□□□□ -2.13
HER1Q12276 SEY1YOR165W 2331 nt1.73□□□□□ -2.13
HER1Q12276 MSH5YDL154W 2706 nt1.73□□□□□ -2.13
HER1Q12276 MLH3YPL164C 2148 nt1.72□□□□□ -2.13
HER1Q12276 NCA2YPR155C 1851 nt1.72□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YDL196WYDL196W 330 nt1.72□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.72□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.72□□□□□ -2.13
HER1Q12276 YLL007CYLL007C 1998 nt1.72□□□□□ -2.13
HER1Q12276 snR85snR85 171 nt1.71□□□□□ -2.14
HER1Q12276 MON2YNL297C 4911 nt1.71□□□□□ -2.14
HER1Q12276 CTR9YOL145C 3234 nt1.71□□□□□ -2.14
HER1Q12276 FAB1YFR019W 6837 nt1.71□□□□□ -2.14
HER1Q12276 HMI1YOL095C 2121 nt1.7□□□□□ -2.14
HER1Q12276 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.7□□□□□ -2.14
HER1Q12276 COY1YKL179C 2040 nt1.7□□□□□ -2.14
HER1Q12276 MYO2YOR326W 4725 nt1.7□□□□□ -2.14
HER1Q12276 FIG4YNL325C 2640 nt1.7□□□□□ -2.14
HER1Q12276 DGR2YKL121W 2559 nt1.69□□□□□ -2.14
HER1Q12276 IRE1YHR079C 3348 nt1.69□□□□□ -2.14
HER1Q12276 snR48snR48 113 nt1.69□□□□□ -2.14
HER1Q12276 PRP42YDR235W 1635 nt1.69□□□□□ -2.14
HER1Q12276 PTP2YOR208W 2253 nt1.69□□□□□ -2.14
HER1Q12276 AIM44YPL158C 2277 nt1.69□□□□□ -2.14
HER1Q12276 LHS1YKL073W 2646 nt1.69□□□□□ -2.14
HER1Q12276 AHC1YOR023C 1701 nt1.69□□□□□ -2.14
HER1Q12276 PIP2YOR363C 2991 nt1.68□□□□□ -2.14
HER1Q12276 PIG1YLR273C 1947 nt1.68□□□□□ -2.14
HER1Q12276 HAL9YOL089C 3093 nt1.68□□□□□ -2.14
HER1Q12276 KCS1YDR017C 3153 nt1.68□□□□□ -2.14
HER1Q12276 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.67□□□□□ -2.14
HER1Q12276 YBL053WYBL053W 375 nt1.67□□□□□ -2.14
HER1Q12276 YOR093CYOR093C 4947 nt1.67□□□□□ -2.14
HER1Q12276 MSH6YDR097C 3729 nt1.66□□□□□ -2.14
HER1Q12276 BPH1YCR032W 6504 nt1.66□□□□□ -2.14
HER1Q12276 SNU13YEL026W 381 nt1.66□□□□□ -2.14
HER1Q12276 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.66□□□□□ -2.14
HER1Q12276 ADR1YDR216W 3972 nt1.66□□□□□ -2.14
HER1Q12276 YOR019WYOR019W 2193 nt1.65□□□□□ -2.14
HER1Q12276 YDR521WYDR521W 336 nt1.65□□□□□ -2.15
HER1Q12276 FRK1YPL141C 2598 nt1.65□□□□□ -2.15
HER1Q12276 IRA1YBR140C 9279 nt1.64□□□□□ -2.15
HER1Q12276 SPO24YPR036W-A 204 nt1.64□□□□□ -2.15
HER1Q12276 IFH1YLR223C 3258 nt1.64□□□□□ -2.15
HER1Q12276 SLD3YGL113W 2007 nt1.64□□□□□ -2.15
HER1Q12276 ALK1YGL021W 2283 nt1.64□□□□□ -2.15
HER1Q12276 SBE22YHR103W 2559 nt1.63□□□□□ -2.15
HER1Q12276 SKI3YPR189W 4299 nt1.63□□□□□ -2.15
HER1Q12276 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.62□□□□□ -2.15
HER1Q12276 YBR206WYBR206W 324 nt1.62□□□□□ -2.15
HER1Q12276 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.62□□□□□ -2.15
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