Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.65□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.65□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 RPL39YJL189W 156 nt1.65□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 YAR029WYAR029W 225 nt1.65□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 YPR063CYPR063C 423 nt1.64□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 CUL3YGR003W 2235 nt1.64□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 MPT5YGL178W 2580 nt1.63□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 NUP145YGL092W 3954 nt1.63□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 SPT21YMR179W 2277 nt1.63□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 YFL063WYFL063W 456 nt1.63□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 YJR011CYJR011C 786 nt1.63□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 AZF1YOR113W 2745 nt1.63□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 FIG4YNL325C 2640 nt1.63□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 MMS4YBR098W 2076 nt1.62□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 YDL211CYDL211C 1119 nt1.62□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 PTP2YOR208W 2253 nt1.62□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 APL3YBL037W 3078 nt1.62□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 YDR048CYDR048C 315 nt1.61□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 YER097WYER097W 330 nt1.61□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 RPL34BYIL052C 366 nt1.61□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 SEC3YER008C 4011 nt1.6□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 SPO75YLL005C 2607 nt1.6□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 snR36snR36 182 nt1.6□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 AIM44YPL158C 2277 nt1.6□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 YDR521WYDR521W 336 nt1.59□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.59□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.59□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 snR14snR14 160 nt1.59□□□□□ -2.15
NYV1Q12255 VPS15YBR097W 4365 nt1.59□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YCK3YER123W 1575 nt1.59□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 IRA1YBR140C 9279 nt1.58□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 NHP2YDL208W 471 nt1.58□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 GPG1YGL121C 381 nt1.58□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YLL007CYLL007C 1998 nt1.58□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 FYV8YGR196C 2454 nt1.57□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YDR413CYDR413C 576 nt1.57□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YFL032WYFL032W 321 nt1.57□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 PKH2YOL100W 3246 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 HMRA2YCR096C 360 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YHL042WYHL042W 453 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 STE5YDR103W 2754 nt1.56□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 SET3YKR029C 2256 nt1.55□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 RRT15YLR162W-A 189 nt1.55□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 PDE2YOR360C 1581 nt1.55□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 HKR1YDR420W 5409 nt1.54□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YDR344CYDR344C 444 nt1.54□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YJL120WYJL120W 324 nt1.54□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 NUP188YML103C 4968 nt1.54□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YDL206WYDL206W 2289 nt1.54□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YLL020CYLL020C 306 nt1.53□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.53□□□□□ -2.16
NYV1Q12255 NUP157YER105C 4176 nt1.52□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YGL149WYGL149W 306 nt1.52□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YMR321CYMR321C 318 nt1.52□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 SLD3YGL113W 2007 nt1.52□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 DBP6YNR038W 1890 nt1.52□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 UTP20YBL004W 7482 nt1.51□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 EAF1YDR359C 2949 nt1.51□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YNL146WYNL146W 303 nt1.51□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.51□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 CDC39YCR093W 6327 nt1.51□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 SIP4YJL089W 2490 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 SEC21YNL287W 2808 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 NST1YNL091W 3723 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 STB6YKL072W 2301 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 SSS1YDR086C 243 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 UBP3YER151C 2739 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 RSM22YKL155C 1887 nt1.5□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 PBY1YBR094W 2262 nt1.49□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 CDC36YDL165W 576 nt1.49□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.49□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 RPS25BYLR333C 327 nt1.49□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 STO1YMR125W 2586 nt1.48□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YIL032CYIL032C 357 nt1.48□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YBR206WYBR206W 324 nt1.48□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 KAP120YPL125W 3099 nt1.48□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.47□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.47□□□□□ -2.17
NYV1Q12255 COG8YML071C 1824 nt1.45□□□□□ -2.18
NYV1Q12255 SPO21YOL091W 1830 nt1.45□□□□□ -2.18
NYV1Q12255 MDS3YGL197W 4464 nt1.44□□□□□ -2.18
NYV1Q12255 ALG13YGL047W 609 nt1.44□□□□□ -2.18
NYV1Q12255 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.43□□□□□ -2.18
NYV1Q12255 YBR174CYBR174C 315 nt1.43□□□□□ -2.18
NYV1Q12255 snR65snR65 100 nt1.41□□□□□ -2.18
NYV1Q12255 VIK1YPL253C 1944 nt1.4□□□□□ -2.18
NYV1Q12255 PAM16YJL104W 450 nt1.4□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 PRP16YKR086W 3216 nt1.4□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 snR60snR60 104 nt1.39□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 RPS27BYHR021C 249 nt1.39□□□□□ -2.19
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