Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.78□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.78□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 PAA1YDR071C 576 nt-0.79□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.8□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 PBI2YNL015W 228 nt-0.81□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.81□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 snR59snR59 78 nt-0.82□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 BLS1YLR408C 369 nt-0.82□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 DIE2YGR227W 1578 nt-0.82□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 YAP6YDR259C 1152 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 RMD6YEL072W 696 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 SDS22YKL193C 1017 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 LIN1YHR156C 1023 nt-0.84□□□□□ -2.54
TY1B-LR1Q12088 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YOL106WYOL106W 354 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YOR248WYOR248W 303 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 ATC1YDR184C 885 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 MRPS8YMR158W 468 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 DCP1YOL149W 696 nt-0.86□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 GRX5YPL059W 453 nt-0.86□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 SNU56YDR240C 1479 nt-0.86□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-0.88□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.89□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 ECL1YGR146C 636 nt-0.89□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.89□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 COG6YNL041C 2520 nt-0.89□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 POP6YGR030C 477 nt-0.9□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YGR115CYGR115C 780 nt-0.9□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.91□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 PSF2YJL072C 642 nt-0.91□□□□□ -2.55
TY1B-LR1Q12088 QCR7YDR529C 384 nt-0.91□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 IPP1YBR011C 864 nt-0.91□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YPR096CYPR096C 303 nt-0.91□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 SPO21YOL091W 1830 nt-0.92□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 COX7YMR256C 183 nt-0.92□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.93□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 snR57snR57 88 nt-0.93□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.93□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 GPX1YKL026C 504 nt-0.93□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.93□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.94□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YHR138CYHR138C 345 nt-0.94□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YDR269CYDR269C 324 nt-0.95□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YLR171WYLR171W 390 nt-0.95□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.95□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 snR161snR161 161 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YNL319WYNL319W 441 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YOR345CYOR345C 351 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.97□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.97□□□□□ -2.56
TY1B-LR1Q12088 LRP1YHR081W 555 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 RPS25BYLR333C 327 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YLR198CYLR198C 360 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YPL261CYPL261C 309 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 CWC23YGL128C 852 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YIR044CYIR044C 186 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YKL111CYKL111C 336 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 IRC16YPR038W 360 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-1.03□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-1.03□□□□□ -2.57
TY1B-LR1Q12088 YKL202WYKL202W 582 nt-1.03□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 YML108WYML108W 318 nt-1.03□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 ACF4YJR083C 930 nt-1.04□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 YBR099CYBR099C 384 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 RPS20YHL015W 366 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 VAM3YOR106W 852 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 POL32YJR043C 1053 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 ILM1YJR118C 612 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 YOL029CYOL029C 606 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 RRI2YOL117W 1938 nt-1.09□□□□□ -2.58
TY1B-LR1Q12088 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 ATG31YDR022C 591 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 PCF11YDR228C 1881 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YGR228WYGR228W 345 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 snR51snR51 107 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 LOC1YFR001W 615 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YHL041WYHL041W 450 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 CMC1YKL137W 336 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 BER1YLR412W 825 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YER079WYER079W 633 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 RPS30AYLR287C-A 192 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YGL239CYGL239C 315 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 RPF1YHR088W 888 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YOR364WYOR364W 369 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 TAR1YLR154W-C 375 nt-1.14□□□□□ -2.59
TY1B-LR1Q12088 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-1.14□□□□□ -2.59
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