Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 YPL150WYPL150W 2706 nt3.37□□□□□ -1.87
NOP53Q12080 MDS3YGL197W 4464 nt3.37□□□□□ -1.87
NOP53Q12080 HMI1YOL095C 2121 nt3.36□□□□□ -1.87
NOP53Q12080 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt3.36□□□□□ -1.87
NOP53Q12080 PDR8YLR266C 2106 nt3.35□□□□□ -1.87
NOP53Q12080 PDR3YBL005W 2931 nt3.35□□□□□ -1.87
NOP53Q12080 SMC6YLR383W 3345 nt3.35□□□□□ -1.87
NOP53Q12080 YLL020CYLL020C 306 nt3.35□□□□□ -1.87
NOP53Q12080 IKI3YLR384C 4050 nt3.34□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 CAF120YNL278W 3183 nt3.34□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 PKH2YOL100W 3246 nt3.34□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 MAK10YEL053C 2202 nt3.34□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 SNQ2YDR011W 4506 nt3.33□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 MLH3YPL164C 2148 nt3.33□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 BPT1YLL015W 4680 nt3.31□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 NUM1YDR150W 8247 nt3.3□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 SSN2YDR443C 4263 nt3.29□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt3.29□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt3.29□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 BFR2YDR299W 1605 nt3.29□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 ISW1YBR245C 3390 nt3.29□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 SET3YKR029C 2256 nt3.28□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt3.28□□□□□ -1.88
NOP53Q12080 COG4YPR105C 2586 nt3.27□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt3.27□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 FKS3YMR306W 5358 nt3.27□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 HSL1YKL101W 4557 nt3.27□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 AMS1YGL156W 3252 nt3.26□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt3.26□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt3.26□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 ESL2YKR096W 3588 nt3.26□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 MSH5YDL154W 2706 nt3.26□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 NUP157YER105C 4176 nt3.26□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 COG6YNL041C 2520 nt3.24□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 TAH1YCR060W 336 nt3.24□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 MRD1YPR112C 2664 nt3.24□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 ESC1YMR219W 4977 nt3.23□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 CHC1YGL206C 4962 nt3.23□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt3.23□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 RPL37BYDR500C 267 nt3.23□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 YNL266WYNL266W 420 nt3.22□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 IST2YBR086C 2841 nt3.22□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 UBR1YGR184C 5853 nt3.22□□□□□ -1.89
NOP53Q12080 SAP185YJL098W 3177 nt3.21□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt3.21□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt3.21□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 RPO41YFL036W 4056 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YER138CYER138C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YER160CYER160C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YJR027WYJR027W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YML039WYML039W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YML045WYML045W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YMR050CYMR050C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 NUP100YKL068W 2880 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 SLI15YBR156C 2097 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 UFD2YDL190C 2886 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 BCK1YJL095W 4437 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 EAF1YDR359C 2949 nt3.2□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YDL206WYDL206W 2289 nt3.19□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt3.19□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 BIR1YJR089W 2865 nt3.18□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 BUD2YKL092C 3315 nt3.18□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 AGC1YPR021C 2709 nt3.17□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 KAP120YPL125W 3099 nt3.17□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 SGM1YJR134C 2124 nt3.16□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 SEC26YDR238C 2922 nt3.16□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 AXL1YPR122W 3627 nt3.15□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 GEA1YJR031C 4227 nt3.15□□□□□ -1.9
NOP53Q12080 YDR210WYDR210W 228 nt3.15□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt3.15□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 SGS1YMR190C 4344 nt3.15□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 VPS8YAL002W 3825 nt3.14□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 PDR1YGL013C 3207 nt3.13□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 MOT1YPL082C 5604 nt3.13□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 CYR1YJL005W 6081 nt3.12□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 ADR1YDR216W 3972 nt3.12□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 ECM29YHL030W 5607 nt3.11□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 MET18YIL128W 3099 nt3.11□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 TOM1YDR457W 9807 nt3.11□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 SEC1YDR164C 2175 nt3.1□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt3.1□□□□□ -1.91
NOP53Q12080 YEF3YLR249W 3135 nt3.09□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 SEC7YDR170C 6030 nt3.09□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 GIP3YPL137C 3831 nt3.08□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 YER172C-AYER172C-A 381 nt3.08□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 COX5BYIL111W 456 nt3.08□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 SCP160YJL080C 3669 nt3.07□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 TRS130YMR218C 3309 nt3.06□□□□□ -1.92
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