Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 INA22YIR024C 651 nt1.11□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YDL073WYDL073W 2955 nt1.11□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YDL206WYDL206W 2289 nt1.1□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 PKH2YOL100W 3246 nt1.1□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 RPL34BYIL052C 366 nt1.1□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.1□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 CUL3YGR003W 2235 nt1.09□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 BUD3YCL014W 4911 nt1.09□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 VAM6YDL077C 3150 nt1.09□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 APL1YJR005W 2103 nt1.09□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 RPS20YHL015W 366 nt1.09□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.09□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 PAM16YJL104W 450 nt1.08□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.08□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 LEE1YPL054W 906 nt1.08□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 VAR1Q0140 1197 nt1.07□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 IRC23YOR044W 474 nt1.07□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 YOR121CYOR121C 306 nt1.07□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 SMC1YFL008W 3678 nt1.07□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 NIP100YPL174C 2607 nt1.06□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 SCC2YDR180W 4482 nt1.06□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 WAR1YML076C 2835 nt1.06□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 MAM33YIL070C 801 nt1.06□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 PCC1YKR095W-A 267 nt1.05□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 BEM2YER155C 6504 nt1.04□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.04□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.04□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.04□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 DOP1YDR141C 5097 nt1.04□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 PTP2YOR208W 2253 nt1.04□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 YDR426CYDR426C 378 nt1.03□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 OST1YJL002C 1431 nt1.03□□□□□ -2.24
SPE3Q12074 KAP120YPL125W 3099 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 YHL042WYHL042W 453 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 YLL007CYLL007C 1998 nt1.02□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 QCR9YGR183C 201 nt1.01□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 PRP16YKR086W 3216 nt1□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 YJR011CYJR011C 786 nt0.99□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.99□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 YDR157WYDR157W 402 nt0.97□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 YDR521WYDR521W 336 nt0.97□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.97□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.97□□□□□ -2.25
SPE3Q12074 YDL196WYDL196W 330 nt0.96□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 ISD11YER048W-A 285 nt0.96□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.96□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 YAR053WYAR053W 297 nt0.96□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 YMR160WYMR160W 2451 nt0.95□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 CSN9YDR179C 489 nt0.94□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 ALG13YGL047W 609 nt0.92□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 YGR035CYGR035C 351 nt0.92□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 IES4YOR189W 351 nt0.92□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 DBP6YNR038W 1890 nt0.91□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 HMRA2YCR096C 360 nt0.91□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 YOR282WYOR282W 321 nt0.91□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 BIL1YOR304C-A 231 nt0.91□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 YBR206WYBR206W 324 nt0.91□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 GEA2YEL022W 4380 nt0.9□□□□□ -2.26
SPE3Q12074 YBR064WYBR064W 429 nt0.89□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 BIR1YJR089W 2865 nt0.88□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 YCK3YER123W 1575 nt0.88□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 YFL019CYFL019C 354 nt0.88□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 HTB2YBL002W 396 nt0.88□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 YAR029WYAR029W 225 nt0.87□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 RPL35AYDL191W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 OLI1Q0130 231 nt0.86□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 YLR334CYLR334C 381 nt0.86□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 YPL044CYPL044C 549 nt0.86□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.85□□□□□ -2.27
SPE3Q12074 SPO21YOL091W 1830 nt0.83□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 PMP1YCR024C-A 123 nt0.83□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.83□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.83□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 NOP9YJL010C 2001 nt0.82□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 PAA1YDR071C 576 nt0.82□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 RPS25BYLR333C 327 nt0.82□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 BFR2YDR299W 1605 nt0.82□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 LTE1YAL024C 4308 nt0.81□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 YDR344CYDR344C 444 nt0.81□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 CMC4YMR194C-B 222 nt0.81□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.81□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 MCM10YIL150C 1716 nt0.81□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.8□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.8□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.8□□□□□ -2.28
SPE3Q12074 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.8□□□□□ -2.28
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