Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	PDE2	YOR360C	1581 nt		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	Q12045	BUD3	YCL014W	4911 nt		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	Q12045	YLR154W-F	YLR154W-F	141 nt		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	Q12045	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	Q12045	MMS4	YBR098W	2076 nt		0.91	□□□□□ -2.26
VIK1	Q12045	RPL38	YLR325C	237 nt		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	AIM44	YPL158C	2277 nt		0.9	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YJR011C	YJR011C	786 nt		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	IRC23	YOR044W	474 nt		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YOR121C	YOR121C	306 nt		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YBR200W-A	YBR200W-A	165 nt		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YGR130C	YGR130C	2451 nt		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YDL206W	YDL206W	2289 nt		0.89	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YAR009C	YAR009C	3591 nt		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	CSN9	YDR179C	489 nt		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YDR426C	YDR426C	378 nt		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	MAM33	YIL070C	801 nt		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		0.88	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	PAN2	YGL094C	3348 nt		0.87	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	PKH2	YOL100W	3246 nt		0.87	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YDL073W	YDL073W	2955 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	GPG1	YGL121C	381 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YHL042W	YHL042W	453 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	YBR206W	YBR206W	324 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	PAU24	YBR301W	363 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VIK1	Q12045	WAR1	YML076C	2835 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YDR521W	YDR521W	336 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YDL196W	YDL196W	330 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YDR157W	YDR157W	402 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YIR044C	YIR044C	186 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YBR064W	YBR064W	429 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	RIM20	YOR275C	1986 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	TTI1	YKL033W	3117 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	PRP16	YKR086W	3216 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YAR053W	YAR053W	297 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	CUL3	YGR003W	2235 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YLL007C	YLL007C	1998 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	PCC1	YKR095W-A	267 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	GEA2	YEL022W	4380 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	RKR1	YMR247C	4689 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	YPR117W	YPR117W	7470 nt		0.78	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	RPL35A	YDL191W	363 nt		0.78	□□□□□ -2.28
VIK1	Q12045	UBP3	YER151C	2739 nt		0.78	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	YFL019C	YFL019C	354 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	YLR334C	YLR334C	381 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	YCK3	YER123W	1575 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	YGR035C	YGR035C	351 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	BFR2	YDR299W	1605 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	ALG13	YGL047W	609 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	MCM10	YIL150C	1716 nt		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	YAR029W	YAR029W	225 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	PTP2	YOR208W	2253 nt		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	ISD11	YER048W-A	285 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	HTB2	YBL002W	396 nt		0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	OST1	YJL002C	1431 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	YDR344C	YDR344C	444 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	YHR007C-A	YHR007C-A	216 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	SEC1	YDR164C	2175 nt		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	ASE1	YOR058C	2658 nt		0.71	□□□□□ -2.29
VIK1	Q12045	DBP6	YNR038W	1890 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	OLI1	Q0130	231 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YJL120W	YJL120W	324 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YMR272W-A	YMR272W-A	114 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	BIL1	YOR304C-A	231 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	ECM12	YHR021W-A	456 nt		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	NOP9	YJL010C	2001 nt		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	NHP2	YDL208W	471 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	RPS25B	YLR333C	327 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YOR011W-A	YOR011W-A	207 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	IES4	YOR189W	351 nt		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	SPO21	YOL091W	1830 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	PMP1	YCR024C-A	123 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	HMRA2	YCR096C	360 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	SSS1	YDR086C	243 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	CMC4	YMR194C-B	222 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YPR159C-A	YPR159C-A	102 nt		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YMR031W-A	YMR031W-A	327 nt		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YOR282W	YOR282W	321 nt		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YDR048C	YDR048C	315 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	TAR1	YLR154W-C	375 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YPL225W	YPL225W	441 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YPR012W	YPR012W	255 nt		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	Q12045	YNL211C	YNL211C	261 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	YPL044C	YPL044C	549 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		0.65	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		0.64	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	LTE1	YAL024C	4308 nt		0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	INA22	YIR024C	651 nt		0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	PAM16	YJL104W	450 nt		0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	SGF11	YPL047W	300 nt		0.63	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	CHS6	YJL099W	2241 nt		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	YAF9	YNL107W	681 nt		0.62	□□□□□ -2.31
VIK1	Q12045	NPR2	YEL062W	1848 nt		0.6	□□□□□ -2.31

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