Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms