Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNDQ07001 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms