Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms