Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNP2Q05952 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms