Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 YJR011CYJR011C 786 nt0.37□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YBR206WYBR206W 324 nt0.37□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YAP6YDR259C 1152 nt0.36□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 RPL26AYLR344W 384 nt0.36□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 INP2YMR163C 2118 nt0.36□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YPL229WYPL229W 621 nt0.36□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 snR54snR54 86 nt0.36□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 MAM33YIL070C 801 nt0.35□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YKL083WYKL083W 615 nt0.35□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 TOM22YNL131W 459 nt0.35□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 NIP100YPL174C 2607 nt0.34□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 CUL3YGR003W 2235 nt0.34□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 ASE1YOR058C 2658 nt0.34□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YDL158CYDL158C 309 nt0.34□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 OLI1Q0130 231 nt0.34□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YLR171WYLR171W 390 nt0.34□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 BSC3YLR465C 309 nt0.34□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YLL007CYLL007C 1998 nt0.34□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 RPS20YHL015W 366 nt0.33□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.33□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YIR044CYIR044C 186 nt0.33□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YLR101CYLR101C 396 nt0.33□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YPL044CYPL044C 549 nt0.33□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YSP1YHR155W 3687 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 MYO1YHR023W 5787 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 ATG31YDR022C 591 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 RPL26BYGR034W 384 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 ECL1YGR146C 636 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 RPS24BYIL069C 408 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 ISF1YMR081C 1017 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YNL058CYNL058C 951 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 snR41snR41 95 nt0.32□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 PCF11YDR228C 1881 nt0.31□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YAR047CYAR047C 321 nt0.31□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 MRPL50YNR022C 420 nt0.3□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 FYV10YIL097W 1551 nt0.3□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.29□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.29□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.29□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.28□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 ABF2YMR072W 552 nt0.28□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YOR218CYOR218C 420 nt0.28□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.28□□□□□ -2.36
CUE4Q04201 SBH1YER087C-B 249 nt0.27□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.27□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 PTP2YOR208W 2253 nt0.26□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.26□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.26□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.26□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YPL185WYPL185W 396 nt0.26□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 PAU12YGR294W 363 nt0.25□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.25□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YNL211CYNL211C 261 nt0.25□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.24□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YDR426CYDR426C 378 nt0.24□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 PAM16YJL104W 450 nt0.24□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 ATP19YOL077W-A 207 nt0.24□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 YLR456WYLR456W 615 nt0.23□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 PRP5YBR237W 2550 nt0.23□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 PET111YMR257C 2403 nt0.22□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 SPO21YOL091W 1830 nt0.22□□□□□ -2.37
CUE4Q04201 FMP27YLR454W 7887 nt0.21□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 PAA1YDR071C 576 nt0.21□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.21□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 OST4YDL232W 111 nt0.2□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.2□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.19□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YLR334CYLR334C 381 nt0.19□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 snR189snR189 189 nt0.19□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 BEM3YPL115C 3387 nt0.19□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 COX5BYIL111W 456 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 TAR1YLR154W-C 375 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YLR434CYLR434C 384 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YMR321CYMR321C 318 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YOR053WYOR053W 342 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 VIK1YPL253C 1944 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 UTP20YBL004W 7482 nt0.18□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.17□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YNL303WYNL303W 348 nt0.17□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 SGF11YPL047W 300 nt0.17□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YPL068CYPL068C 882 nt0.17□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YPL225WYPL225W 441 nt0.17□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 HAL9YOL089C 3093 nt0.17□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.16□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YOR345CYOR345C 351 nt0.16□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 ESP1YGR098C 4893 nt0.16□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 PRP42YDR235W 1635 nt0.16□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 SEC8YPR055W 3198 nt0.16□□□□□ -2.38
CUE4Q04201 YJL120WYJL120W 324 nt0.15□□□□□ -2.39
CUE4Q04201 YMR160WYMR160W 2451 nt0.14□□□□□ -2.39
CUE4Q04201 HMRA2YCR096C 360 nt0.14□□□□□ -2.39
CUE4Q04201 CSN9YDR179C 489 nt0.14□□□□□ -2.39
CUE4Q04201 PCC1YKR095W-A 267 nt0.14□□□□□ -2.39
CUE4Q04201 RPS25BYLR333C 327 nt0.14□□□□□ -2.39
CUE4Q04201 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.14□□□□□ -2.39
CUE4Q04201 ORC3YLL004W 1851 nt0.14□□□□□ -2.39
CUE4Q04201 OST1YJL002C 1431 nt0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.9 ms