Protein–RNA interactions for Protein: Q03981

CSN9, COP9 signalosome complex subunit 9, yeastyeast

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSN9Q03981 NFU1YKL040C 771 nt-0.36□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.36□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 ASE1YOR058C 2658 nt-0.36□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 RPS26AYGL189C 360 nt-0.37□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 MAM33YIL070C 801 nt-0.37□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.38□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.38□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YOL160WYOL160W 342 nt-0.38□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 RAD34YDR314C 2079 nt-0.39□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 PAA1YDR071C 576 nt-0.4□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YAP6YDR259C 1152 nt-0.4□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.4□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.4□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-0.4□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 HAL9YOL089C 3093 nt-0.4□□□□□ -2.47
CSN9Q03981 YGL239CYGL239C 315 nt-0.41□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YGR164WYGR164W 336 nt-0.41□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.41□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 snR46snR46 197 nt-0.41□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 RAD61YDR014W 1944 nt-0.42□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 snR8snR8 190 nt-0.42□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.42□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YNL146WYNL146W 303 nt-0.42□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YIR044CYIR044C 186 nt-0.43□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 ECM9YKR004C 1134 nt-0.43□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YPL261CYPL261C 309 nt-0.43□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YPR039WYPR039W 336 nt-0.43□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 SPO21YOL091W 1830 nt-0.43□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 PRP39YML046W 1890 nt-0.44□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 PBI2YNL015W 228 nt-0.44□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YNL211CYNL211C 261 nt-0.44□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 snR128snR128 126 nt-0.44□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 SNU56YDR240C 1479 nt-0.44□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 NNF2YGR089W 2811 nt-0.45□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 SBH2YER019C-A 267 nt-0.45□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YGR115CYGR115C 780 nt-0.45□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 APQ13YJL075C 417 nt-0.45□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.45□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 SEC10YLR166C 2616 nt-0.46□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 SOV1YMR066W 2697 nt-0.46□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 MRPL32YCR003W 552 nt-0.47□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 snR72snR72 98 nt-0.47□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 YOR345CYOR345C 351 nt-0.47□□□□□ -2.48
CSN9Q03981 EMC4YGL231C 573 nt-0.48□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 POP7YBR167C 423 nt-0.48□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YBR206WYBR206W 324 nt-0.48□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.49□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YKL202WYKL202W 582 nt-0.49□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YLR101CYLR101C 396 nt-0.49□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YKU70YMR284W 1809 nt-0.5□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 CSE1YGL238W 2883 nt-0.52□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 snR9snR9 187 nt-0.52□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YPT6YLR262C 648 nt-0.52□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YML108WYML108W 318 nt-0.52□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 DCP1YOL149W 696 nt-0.52□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 COY1YKL179C 2040 nt-0.52□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 NIP1YMR309C 2439 nt-0.53□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YER135CYER135C 393 nt-0.53□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 YMR254CYMR254C 309 nt-0.53□□□□□ -2.49
CSN9Q03981 SCEIQ0160 708 nt-0.54□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.54□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 UBS1YBR165W 834 nt-0.54□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 PTP2YOR208W 2253 nt-0.55□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.55□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 UTP8YGR128C 2142 nt-0.56□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.56□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YJR011CYJR011C 786 nt-0.56□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YLR171WYLR171W 390 nt-0.56□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YOL029CYOL029C 606 nt-0.56□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 URB1YKL014C 5295 nt-0.56□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YEL073CYEL073C 324 nt-0.57□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 HUR1YGL168W 333 nt-0.58□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.58□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 YPL225WYPL225W 441 nt-0.59□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 snR51snR51 107 nt-0.59□□□□□ -2.5
CSN9Q03981 MND1YGL183C 660 nt-0.6□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.6□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YJL007CYJL007C 315 nt-0.6□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 NIP100YPL174C 2607 nt-0.61□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.61□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.61□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 IPP1YBR011C 864 nt-0.61□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YPL182CYPL182C 384 nt-0.62□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.62□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YGL230CYGL230C 444 nt-0.63□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 RPS20YHL015W 366 nt-0.63□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 SVS1YPL163C 783 nt-0.63□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.64□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.64□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 HTB2YBL002W 396 nt-0.64□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YGR025WYGR025W 303 nt-0.65□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 TIM13YGR181W 318 nt-0.65□□□□□ -2.51
CSN9Q03981 YCR001WYCR001W 315 nt-0.66□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.67□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 SDH7YDR511W 402 nt-0.67□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 YPL205CYPL205C 345 nt-0.67□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 YCR022CYCR022C 345 nt-0.69□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.69□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 ATG31YDR022C 591 nt-0.69□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 ECL1YGR146C 636 nt-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms