Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNC4Q03721 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNC4Q03721 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNC4Q03721 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNC4Q03721 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNC4Q03721 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNC4Q03721 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNC4Q03721 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNC4Q03721 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms