Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TAP2Q03519 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAP2Q03519 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms