Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms