Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms