Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PKD1P98161 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKD1P98161 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKD1P98161 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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