Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN10P78369 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN10P78369 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms