Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKP1P63208 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKP1P63208 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SKP1P63208 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKP1P63208 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SKP1P63208 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP1P63208 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms