Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms