Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO4P61968 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms