Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UFM1P61960 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UFM1P61960 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UFM1P61960 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFM1P61960 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms