Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF3P61204 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARF3P61204 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARF3P61204 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms