Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP11P59045 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms