Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA9P57773 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA9P57773 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA9P57773 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA9P57773 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA9P57773 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA9P57773 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA9P57773 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA9P57773 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA9P57773 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms