Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO3P55854 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms