Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP6P55212 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP6P55212 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP6P55212 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP6P55212 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP6P55212 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP6P55212 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP6P55212 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP6P55212 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms