Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRISP3P54108 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms