Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP98P52948 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP98P52948 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP98P52948 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP98P52948 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP98P52948 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP98P52948 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms