Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DAP3P51398 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DAP3P51398 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DAP3P51398 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DAP3P51398 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DAP3P51398 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms