Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERFP50548 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERFP50548 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERFP50548 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERFP50548 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERFP50548 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERFP50548 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERFP50548 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERFP50548 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERFP50548 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERFP50548 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERFP50548 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms